Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
LRRTM2O43300 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
LRRTM2O43300 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
LRRTM2O43300 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
LRRTM2O43300 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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