Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRGMA1A4Y4 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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