Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SH3BP4Q9P0V3 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SH3BP4Q9P0V3 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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