Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SAMD8Q96LT4 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SAMD8Q96LT4 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SAMD8Q96LT4 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SAMD8Q96LT4 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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