Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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