Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CSPP1Q1MSJ5 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CSPP1Q1MSJ5 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CSPP1Q1MSJ5 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms