Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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