Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRNQ16849 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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PTPRNQ16849 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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PTPRNQ16849 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPRNQ16849 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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