Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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