Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms