Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDCD1Q15116 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PDCD1Q15116 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms