Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms