Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERC3Q15034 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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