Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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