Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HNF4GQ14541 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HNF4GQ14541 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms