Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HDAC1Q13547 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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