Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RIGQ13278 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms