Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3BQ13214 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms