Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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