Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RESTQ13127 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RESTQ13127 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RESTQ13127 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms