Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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BNIP1Q12981 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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