Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KIF5AQ12840 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KIF5AQ12840 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms