Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF543Q08ER8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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