Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRP1Q07954 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms