Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms