Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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FOXQ1Q9C009 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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