Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RBM42Q9BTD8 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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