Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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