Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC47Q96A33 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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