Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CLPPQ16740 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.8 ms