Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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