Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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GRIK4Q16099 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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GRIK4Q16099 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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GRIK4Q16099 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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GRIK4Q16099 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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