Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPAQ15257 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPAQ15257 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms