Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERC3Q15034 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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