Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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COL19A1Q14993 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL19A1Q14993 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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