Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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