Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BECN1Q14457 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
BECN1Q14457 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms