Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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UBE4AQ14139 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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UBE4AQ14139 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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UBE4AQ14139 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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UBE4AQ14139 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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UBE4AQ14139 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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UBE4AQ14139 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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UBE4AQ14139 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE4AQ14139 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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