Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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