Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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