Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
BFSP2Q13515 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BFSP2Q13515 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms