Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCGQ13326 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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