Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TRAF3Q13114 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.3 ms