Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN3Q13064 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN3Q13064 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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