Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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