Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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