Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHRNEQ04844 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms