Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHOC2Q9UQ13 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHOC2Q9UQ13 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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