Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms