Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SENP3Q9H4L4 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
SENP3Q9H4L4 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SENP3Q9H4L4 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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